La Iglesia ni Cristo (INC) es una iglesia protestante indígena seguida por una minoría grande y altamente visible del 2,3% de filipinos. Fue fundada por Félix Manalo Isugan (1886-1963), quien se había criado en la Iglesia Católica Romana y cuando era adolescente se convirtió en miembro de una variedad de iglesias protestantes y exploró los sistemas de creencias indígenas antes de fundar la INC. Manalo fue un líder carismático que los miembros de la iglesia creen que es el último profeta de Dios en la tierra, y cuyo legado sigue siendo fuerte en el INC. El INC apeló a los filipinos desencantados con la Iglesia Católica a finales del período colonial español y principios del período estadounidense, y continúa disputando la doctrina católica básica, incluido el trinitarismo, la divinidad de Cristo, el bautismo de bebés y la autoridad papal. El INC sostiene que es la única iglesia cristiana «verdadera» a través de la cual la salvación es posible.
El INC se expandió rápidamente durante el renacimiento religioso filipino después de la Segunda Guerra Mundial. A diferencia de la Iglesia de Aglipayan, el INC es un fenómeno global con sucursales en cualquier lugar donde residan grandes poblaciones filipinas, e incluye miembros más limitados de otros países del Sudeste asiático. El INC tiene una influencia considerable y controvertida en la vida política de Filipinas, alentando el voto en bloque para los políticos elegidos, e impacta a la sociedad civil en educación, atención médica, deportes, activismo ambiental, medios de comunicación y en la prestación de servicios sociales. También es reconocido por el estilo arquitectónico distintivo de los edificios de la iglesia y el impacto visual que han tenido en el paisaje filipino.