«NCIS» tiene una forma de hacer que los fans se enamoren de los personajes. El espectáculo, que ha estado en el aire durante 19 temporadas, presenta personajes a los que los fanáticos no pueden dejar de apegarse. Algunos de los personajes más queridos de la serie incluyen al agente Jethro Gibbs, Abby Sciuto y el Dr. Donald «Ducky» Mallard, solo por nombrar algunos (por la hoja de trucos del Mundo del Espectáculo).
Desde que el programa ha estado en televisión durante tanto tiempo, los personajes queridos han ido y venido. De hecho, «NCIS» se ha vuelto un poco notorio por perder personajes a los que los fanáticos están especialmente apegados. Recientemente, el agente Gibbs, interpretado por Mark Harmon, hizo oficialmente su descanso del espectáculo, pero los fanáticos no lo están comprando (a través de Good Housekeeping). Alguien notó que Gibbs todavía se muestra en los créditos de introducción, con la esperanza de que regrese a su programa favorito en algún momento durante la temporada.
Sin embargo, no todos son tan afortunados como Gibbs, yendo y viniendo como les plazca. «NCIS» ha insinuado que algunas de las parejas románticas de los personajes a largo plazo de la serie se encuentran con un final desafortunado. El director del NCIS en el programa, Leon Vance, es uno de esos personajes. El personaje ha sido parte del elenco desde detrás de escena desde la quinta temporada de la serie, pero ¿qué le pasó a su esposa, Jackie? Tristemente, la perdió al igual que el agente Gibbs y Jimmy Palmer (interpretado por Brian Dietzen) perdieron la suya.