lauroilsarcosina de sodio, o Sarkosil, es un detergente que está estructuralmente relacionado con el SDS, excepto que Sarkosil tiene un enlace de enlace peptídico polar y rígido adicional dentro de la columna vertebral hidrofóbica (Fig. 1). Tal rigidez añadida al extremo N de la cadena hidrofóbica podría conducir a una disminución en su capacidad de insertarse libremente en bicapas de membrana hidrofóbicas y proteínas. Esto podría explicar por qué Sarkosyl es más suave que el SDS en su capacidad para desnaturalizar e interrumpir las estructuras de membrana y proteínas. Debido a una diferencia similar en la estructura de la cadena lateral, el detergente de ácido biliar se vuelve más suave que el colato de sodio fuertemente desnaturalizante, que inactiva las proteínas de membrana integrales, como el receptor de serotonina 1A (1). La naturaleza relativamente suave de Sarkosyl se ha explotado al menos en unos pocos casos. Ejemplos importantes incluyen la purificación de los factores sigma de la ARN polimerasa de Escherichia coli solubilizando los cuerpos de inclusión (2) y la solubilización y purificación de la proteína de la tembladera, el prión PrPSc (3, 4). Aunque la comparación de las características estructurales de Sarkosyl con las de otros detergentes sugiere que podría ser eficaz en la solubilización de proteínas de membrana funcionalmente activas, el uso principal de Sarkosyl ha sido para aislar ADN y ARN. La razón principal de esto es que Sarkosyl es altamente eficiente en la disociación de nucleosomas y ribosomas (5). El detergente también desnaturaliza los ácidos nucleicos e inhibe ciertas enzimas, como las desoxirribonucleasas y las ribonucleasas, que podrían degradar estas moléculas.
Gráfico 1 La estructura de Sarkosyl.
