a nátrium # – lauroil-szarkozin vagy Sarkosyl egy olyan mosószer, amely szerkezetileg az SDS-hez kapcsolódik, azzal a különbséggel, hogy a Sarkosylnek további poláris és merev peptidkötési kötése van a hidrofób gerincen belül (ábra. 1). A hidrofób lánc N-terminálisához adott ilyen merevség csökkentheti annak képességét, hogy szabadon beilleszthető legyen a hidrofób membrán kétrétegekbe és fehérjékbe. Ez megmagyarázhatja, hogy a Sarkosyl miért enyhébb az SDS-nél abban a képességében, hogy denaturálja és megzavarja a membrán-és fehérjeszerkezeteket. Az oldallánc szerkezetének hasonló különbsége miatt az epesav detergens CHAPS enyhébbé válik, mint az erősen denaturáló nátrium-choolát, amely inaktiválja az integrált membránfehérjéket, például a szerotonin 1A receptor (1). A Sarkosyl viszonylag enyhe természetét legalább néhány esetben kihasználták. Fontos példák közé tartozik az Escherichia coli RNS polimeráz szigma faktorok tisztítása az inklúziós testek szolubilizálásával (2), valamint a surlókór fehérje, a prion PrPSc (3, 4) oldása és tisztítása. Bár a Sarkosyl szerkezeti jellemzőinek összehasonlítása más mosószerekkel azt sugallja, hogy hatékony lehet a funkcionálisan aktív membránfehérjék szolubilizálásában, a Sarkosyl fő felhasználása a DNS és az RNS izolálása volt. Ennek fő oka az, hogy a Sarkosyl nagyon hatékony a nukleoszómák és riboszómák disszociálásában (5). A detergens denaturálja a nukleinsavakat is, és gátolja bizonyos enzimeket, például a dezoxiribonukleázokat és a ribonukleázokat, amelyek lebonthatják ezeket a molekulákat.
1. ábra. A Sarkosyl szerkezete.
