サルコシル(分子生物学)

Sodium#-lauroylsarcosine、またはSarkosylは、sdsと構造的に関連している洗剤であるが、Sarkosylは疎水性骨格内に追加の極性および剛性のペプチド結合結合を有することを除いて(Fig. 1). 疎水性鎖のN末端に付加されるこのような剛性は、疎水性膜二重層およびタンパク質に自由に挿入されるその能力の低下をもたらす可能性がある。 これは、Sarkosylが膜およびタンパク質構造を変性および破壊する能力においてSDSよりも穏やかである理由を説明することができる。 側鎖構造の類似した違いのために、胆汁酸洗剤チャップは、セロトニン1A受容体(1)などの不可欠な膜タンパク質を不活性化する強く変性するコリン酸ナトリウムよりも穏やかにレンダリングされます。 サルコシルの比較的穏やかな性質は、少なくともいくつかのケースで悪用されています。 重要な例としては、封入体を可溶化することによる大腸菌RNAポリメラーゼsigma因子の精製(2)およびスクレイピータンパク質、プリオンPrPScの可溶化および精製(3、4)が挙げられる。 サルコシルの構造的特徴を他の界面活性剤の構造的特徴と比較すると,機能的に活性な膜タンパク質の可溶化に有効であることが示唆されたが,サルコシルの主な用途はDNAとRNAの単離であった。 この主な理由は、サルコシルがヌクレオソームとリボソームの解離に非常に効率的であるということです(5)。 洗剤はまた、核酸を変性させ、これらの分子を分解する可能性のあるデオキシリボヌクレアーゼおよびリボヌクレアーゼなどの特定の酵素を阻害する。

図1. Sarkosylの構造。

サルコシルの構造。

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