o sódio # – lauroylsarcosine, ou Sarkosyl, é um detergente que seja relacionado estruturalmente ao SDS, exceto que Sarkosyl tem um enlace polar e rígido adicional da ligação do peptide dentro da espinha dorsal hidrofóbica (Fig. 1). Essa rigidez adicionada ao terminal N da cadeia hidrofóbica pode levar a uma diminuição em sua capacidade de ser inserida livremente em bicamadas e proteínas de membrana hidrofóbicas. Isso poderia explicar por que o Sarkosyl é mais suave que o SDS em sua capacidade de desnaturar e interromper as estruturas de membrana e proteína. Devido a uma diferença semelhante na estrutura da cadeia lateral, os sabonetes detergentes do ácido biliar são tornados mais suaves do que o Colato de sódio fortemente desnaturante, que inativa proteínas integrais da membrana, como o receptor de serotonina 1A (1). A natureza relativamente leve do Sarkosyl foi explorada pelo menos em alguns casos. Exemplos importantes incluem a purificação de Escherichia coli RNA polimerase Sigma fatores por corpos de inclusão solubilizantes (2) e a solubilização e purificação da proteína scrapie, o prion PrPSc (3, 4). Embora a comparação das características estruturais do Sarkosyl com as de outros detergentes sugira que pôde ser eficaz em solubilizar proteínas funcionalmente ativas da membrana, o uso principal de Sarkosyl foi isolar o ADN e o RNA. A principal razão para isso é que o Sarkosil é altamente eficiente na dissociação de nucleossomos e ribossomos (5). O detergente também desnatura os ácidos nucléicos e inibe certas enzimas, como desoxirribonucleases e ribonucleases, que podem degradar essas moléculas.
Figura 1. A estrutura do Sarkosyl.
