Sodium # – lauroylsarcosine, sau Sarkosyl, este un detergent care este legat structural de SDS, cu excepția faptului că Sarkosyl are o legătură suplimentară polară și rigidă a legăturii peptidice în coloana vertebrală hidrofobă (Fig. 1). O astfel de rigiditate adăugată la capătul N al lanțului hidrofob ar putea duce la o scădere a capacității sale de a fi inserată liber în bistraturi și proteine cu membrană hidrofobă. Acest lucru ar putea explica de ce Sarkosyl este mai blând decât SDS în capacitatea sa de a denatura și perturba structurile membranei și proteinelor. Datorită unei diferențe similare în structura lanțului lateral, CHAPS-ul de detergent al acidului biliar devine mai blând decât colatul de sodiu puternic denaturat, care inactivează proteinele membranare integrale, cum ar fi receptorul serotoninei 1A (1). Natura relativ ușoară a Sarkosilului a fost exploatată cel puțin în câteva cazuri. Exemple importante includ purificarea ARN polimerazei Escherichia coli sigma factori prin solubilizarea corpurilor de incluziune (2) și solubilizarea și purificarea proteinei scrapie, prionul PrPSc (3, 4). Deși compararea caracteristicilor structurale ale Sarkosilului cu cele ale altor detergenți sugerează că ar putea fi eficient în solubilizarea proteinelor membranare active funcțional, utilizarea majoră a Sarkosilului a fost izolarea ADN și ARN. Principalul motiv pentru aceasta este că Sarkosilul este foarte eficient în disocierea nucleozomilor și ribozomilor (5). Detergentul denaturează, de asemenea, acizii nucleici și inhibă anumite enzime, cum ar fi deoxiribonucleazele și ribonucleazele, care ar putea degrada aceste molecule.
Figura 1. Structura Sarkosyl.
