sodík # – lauroylsarkosin nebo Sarkosyl je detergent, který je strukturálně příbuzný s SDS, kromě toho, že Sarkosyl má v hydrofobní páteři další polární a tuhou peptidovou vazbu (obr. 1). Taková tuhost přidaná k N-konci hydrofobního řetězce by mohla vést ke snížení jeho schopnosti být volně vkládána do hydrofobních membránových dvojvrstv a proteinů. To by mohlo vysvětlit, proč je Sarkosyl mírnější než SDS ve své schopnosti denaturovat a narušovat membránové a proteinové struktury. Vzhledem k podobnému rozdílu ve struktuře postranního řetězce jsou detergenty žlučových kyselin mírnější než silně denaturační cholát sodný, který inaktivuje integrální membránové proteiny, jako je receptor serotoninu 1A (1). Relativně mírná povaha Sarkosylu byla využita alespoň v několika případech. Mezi důležité příklady patří purifikace RNA polymerázových sigma faktorů Escherichia coli solubilizací inkluzních těles (2) a solubilizací a purifikací klusavkového proteinu prion PrPSc (3, 4). Ačkoli srovnání strukturních vlastností Sarkosylu s jinými detergenty naznačuje, že by mohl být účinný při solubilizaci funkčně aktivních membránových proteinů, hlavní použití Sarkosylu bylo izolovat DNA a RNA. Hlavním důvodem je, že Sarkosyl je vysoce účinný při disociaci nukleosomů a ribozomů (5). Detergent také denaturuje nukleové kyseliny a inhibuje určité enzymy, jako jsou deoxyribonukleázy a ribonukleázy, které by mohly tyto molekuly degradovat.
Obrázek 1. Struktura Sarkosyl.
