Iglesia ni Cristo (INC) er en indfødt Protestantisk kirke efterfulgt af et stort og meget synligt 2,3% mindretal af filippinere. Det blev grundlagt af Manalo Isugan (1886-1963), der var opvokset i Den Romersk-Katolske Kirke og som teenager blev medlem af en række protestantiske kirker og udforskede oprindelige trossystemer, før de grundlagde INC. Manalo var en karismatisk leder, der af kirkens medlemmer menes at være Guds sidste profet på jorden, og hvis arv forbliver stærk i INC. INC appellerede til filippinere disenchanted med den katolske kirke i den sene spanske koloniale og tidlige amerikanske periode, og fortsætter med at bestride grundlæggende katolske doktrin, herunder Trinitarisme, Kristi guddommelighed, barnedåb, og pavelig autoritet. INC hævder, at det er den eneste “sande” kristne kirke, gennem hvilken frelse er mulig.
INC ekspanderede hurtigt under den filippinske religiøse genoplivning efter Anden Verdenskrig. i modsætning til Aglipayan-Kirken er INC et globalt fænomen med grene overalt, hvor store Filippinske befolkninger bor, og inkluderer mere begrænset medlemskab fra andre sydøstasiatiske lande. INC har betydelig og kontroversiel indflydelse i Filippinernes politiske liv—opmuntrende blokafstemning for udvalgte politikere—og påvirker civilsamfundet på tværs af uddannelse, sundhedspleje, sport, miljøaktivisme, medierne, og i levering af sociale tjenester. Det er også anerkendt for kirkebygningers særskilte arkitektoniske stil og den visuelle indflydelse, de har haft på det filippinske landskab.