natrium # – lauroylsarcosin eller Sarkosyl er et vaskemiddel, der er strukturelt relateret til SDS, bortset fra at Sarkosyl har en yderligere polær og stiv peptidbindingsforbindelse inden i den hydrofobe rygrad (Fig. 1). En sådan stivhed tilsat til N-terminalen i den hydrofobe kæde kan føre til et fald i dets evne til at blive indsat frit i hydrofobe membran-dobbeltlag og proteiner. Dette kan forklare, hvorfor Sarkosyl er mildere end SDS i sin evne til at denaturere og forstyrre membran-og proteinstrukturer. På grund af en lignende forskel i sidekædestruktur gøres galdesyrevaskemiddelkapperne mildere end det stærkt denaturerende natriumcholat, som inaktiverer integrerede membranproteiner, såsom serotonin 1a-receptoren (1). Den relativt milde karakter af Sarkosyl er blevet udnyttet i det mindste i nogle få tilfælde. Vigtige eksempler inkluderer oprensning af Escherichia coli RNA-polymerase-Sigma-faktorer ved opløseliggørelse af inklusionslegemer (2) og opløseliggørelse og oprensning af scrapieproteinet, prion PrPSc (3, 4). Selvom sammenligning af de strukturelle træk ved Sarkosyl med andre vaskemidler antyder, at det kan være effektivt til opløseliggørelse af funktionelt aktive membranproteiner, har den største anvendelse af Sarkosyl været at isolere DNA og RNA. Hovedårsagen hertil er, at Sarkosyl er yderst effektiv til dissociering af nukleosomer og ribosomer (5). Detergenten denaturerer også nukleinsyrer og hæmmer visse stoffer, såsom deoksyribonukleaser og ribonukleaser, som kan nedbryde disse molekyler.
Figur 1. Strukturen af Sarkosyl.
