Natrium # -Lauroylsarcosin oder Sarkosyl ist ein Detergens, das strukturell mit SDS verwandt ist, mit der Ausnahme, dass Sarkosyl eine zusätzliche polare und starre Peptidbindungsbindung innerhalb des hydrophoben Rückgrats aufweist (Abb. 1). Eine solche Steifigkeit, die dem N-Terminus der hydrophoben Kette hinzugefügt wird, könnte zu einer Abnahme ihrer Fähigkeit führen, frei in hydrophobe Membrandoppelschichten und Proteine eingefügt zu werden. Dies könnte erklären, warum Sarkosyl in seiner Fähigkeit, Membran- und Proteinstrukturen zu denaturieren und zu stören, milder ist als SDS. Aufgrund eines ähnlichen Unterschieds in der Seitenkettenstruktur wird die Gallensäure von CHAPS milder gemacht als das stark denaturierende Natriumcholat, das integrale Membranproteine wie den Serotonin 1A-Rezeptor inaktiviert (1). Die relativ milde Natur von Sarkosyl wurde zumindest in einigen Fällen ausgenutzt. Wichtige Beispiele sind die Reinigung von Escherichia coli RNA-Polymerase-Sigma-Faktoren durch Solubilisierung von Einschlusskörpern (2) und die Solubilisierung und Reinigung des Scrapie-Proteins, des Prions PrPSc (3, 4). Obwohl der Vergleich der strukturellen Merkmale von Sarkosyl mit denen anderer Detergenzien darauf hindeutet, dass es bei der Solubilisierung funktionell aktiver Membranproteine wirksam sein könnte, bestand die Hauptanwendung von Sarkosyl darin, DNA und RNA zu isolieren. Der Hauptgrund dafür ist, dass Sarkosyl Nukleosomen und Ribosomen hocheffizient dissoziiert (5). Das Detergens denaturiert auch Nukleinsäuren und hemmt bestimmte Enzyme wie Desoxyribonukleasen und Ribonukleasen, die diese Moleküle abbauen könnten.
Abbildung 1. Die Struktur von Sarkosyl.
