natrium # – lauroylsarcosine, of Sarkosyl, is een detergent dat structureel verwant is aan SDS, behalve dat Sarkosyl een extra polaire en stijve peptide binding linkage binnen de hydrofobe backbone (Fig. 1). Dergelijke stijfheid die aan het n-eindpunt van de hydrophobic ketting wordt toegevoegd zou tot een daling van zijn capaciteit kunnen leiden om vrij in hydrophobic membraanbilayers en proteã nen worden ingevoegd. Dit zou kunnen verklaren waarom Sarkosyl milder is dan SDS in zijn capaciteit om membraan en eiwitstructuren te denatureren en te verstoren. Vanwege een vergelijkbaar verschil in zijketenstructuur wordt het galzuurwasmiddel CHAPS milder gemaakt dan het sterk denaturerende natriumcholaat, dat integrale membraaneiwitten inactiveert, zoals de serotonine 1A receptor (1). De relatief milde aard van Sarkosyl is ten minste in enkele gevallen benut. Belangrijke voorbeelden zijn de zuivering van Escherichia coli RNA polymerase sigma factoren door het oplossen van inclusie lichamen (2) en de solubilisatie en zuivering van het scrapie eiwit, de prion PrPSc (3, 4). Hoewel de vergelijking van de structurele eigenschappen van Sarkosyl met die van andere detergentia voorstelt dat het in het oplosbaar maken van functioneel actieve membraanproteã nen efficiënt zou kunnen zijn, is het belangrijkste gebruik van Sarkosyl geweest om DNA en RNA te isoleren. De belangrijkste reden hiervoor is dat Sarkosyl zeer efficiënt is in het scheiden van nucleosomen en ribosomen (5). Het detergens denatureert ook nucleic zuren en remt bepaalde enzymen, zoals deoxyribonucleases en ribonucleases, die deze molecules zouden kunnen degraderen.
figuur 1. De structuur van Sarkosyl.
