natrium #-lauroylsarcosine, eller Sarkosyl, är ett tvättmedel som är strukturellt relaterat till SDS, förutom att Sarkosyl har en ytterligare polär och styv peptidbindningslänk i den hydrofoba ryggraden (Fig. 1). Sådan styvhet tillsatt till n-änden av den hydrofoba kedjan kan leda till en minskning av dess förmåga att införas fritt i hydrofoba membranbilayers och proteiner. Detta kan förklara varför Sarkosyl är mildare än SDS i sin förmåga att denaturera och störa membran-och proteinstrukturer. På grund av en liknande skillnad i sidokedjans struktur görs gallsyra-tvättmedlet mildare än det starkt denaturerande natriumkolatet, vilket inaktiverar integrerade membranproteiner, såsom serotonin 1A-receptorn (1). Sarkosyls relativt milda natur har utnyttjats åtminstone i några få fall. Viktiga exempel innefattar rening av Escherichia coli RNA-polymeras Sigma-faktorer genom att solubilisera inklusionskroppar (2) och solubilisering och rening av skrapie-proteinet, prion PrPSc (3, 4). Även om jämförelse av Sarkosyls strukturella egenskaper med andra tvättmedel tyder på att det kan vara effektivt vid solubilisering av funktionellt aktiva membranproteiner, har den huvudsakliga användningen av Sarkosyl varit att isolera DNA och RNA. Den främsta orsaken till detta är att Sarkosyl är mycket effektiv i dissocierande nukleosomer och ribosomer (5). Tvättmedlet denaturerar också nukleinsyror och hämmar vissa enzymer, såsom deoxiribonukleaser och ribonukleaser, vilket kan försämra dessa molekyler.
Figur 1. Strukturen av Sarkosyl.
