natrium # – lauroyylisarkoosiini eli Sarkosyyli on pesuaine, joka muistuttaa rakenteellisesti SDS: ää, paitsi että Sarkosyylillä on hydrofobisessa selkärangassa ylimääräinen polaarinen ja jäykkä peptidisidos (Fig. 1). Tällainen hydrofobisen ketjun n-terminaaliin lisätty jäykkyys voisi johtaa siihen, että sen kyky työntyä vapaasti hydrofobisten kalvojen kaksikerroksiin ja proteiineihin heikkenisi. Tämä voisi selittää, miksi Sarkosyyli on SDS: ää miedompi kyvyssään denaturoida ja häiritä kalvo-ja proteiinirakenteita. Sivuketjun rakenteen samankaltaisen eron vuoksi sappihappopesuaine CHAPS muuttuu miedommaksi kuin voimakkaasti denaturoiva natriumkolaatti, joka inaktivoi integraalisia kalvoproteiineja, kuten serotoniini 1A-reseptoria (1). Sarkosylin suhteellisen lievää luonnetta on käytetty hyväksi ainakin muutamissa tapauksissa. Tärkeitä esimerkkejä ovat Escherichia coli-RNA-polymeraasi-Sigma-tekijöiden puhdistus liuottamalla inkluusiorungot (2) ja scrapie-proteiinin, prioni PrPSc: n (3, 4), liuotus ja puhdistus. Vaikka Sarkosyylin rakenneominaisuuksien vertaaminen muiden pesuaineiden ominaisuuksiin viittaa siihen, että se saattaisi olla tehokas toiminnallisesti aktiivisten kalvoproteiinien liuottamisessa, Sarkosyylin pääasiallinen käyttötarkoitus on ollut DNA: n ja RNA: n eristäminen. Tärkein syy tähän on se, että Sarkosyyli on erittäin tehokas hajottamaan nukleosomeja ja ribosomeja (5). Pesuaine myös denaturoi nukleiinihappoja ja inhiboi tiettyjä entsyymejä, kuten deoksiribonukleaaseja ja ribonukleaaseja, jotka voisivat hajottaa näitä molekyylejä.
Kuva 1. Sarkosylin rakenne.
